指禅宗寺院（丛林）组织规程及寺众（清众）日常生活之规则。即禅家僧堂关于大众行、住、坐、卧等威仪所定之僧制，为丛林众僧所必须遵守之仪则。清，为清净大海众之略称；规，为规矩准绳之意。又以所立之仪轨能清净大众，故称清规。禅宗自达磨东来后三百年中，禅僧多依住律院或岩穴、树下，尚未营立禅刹。至唐代洪州百丈山之怀海禅师为使禅僧之说法住持得以合法，始营建禅刹，并参照大小乘经律，制定丛林规矩，撰清规二卷，广为流行，世称古规、古清规、百丈清规。此为禅家清规之始。
百丈清规一书包括丛林之一切事务，诸如法堂、僧堂、方丈之设置，并由僧众之中选择十贤众担任十职，十职分为西序：首座（前堂、后堂）、书记、知藏、知客、知浴；东序：监寺、维那、副寺、典座、直岁。更设置寮元、堂主、化主、庄主、知殿等，一切事皆有专职负责之人。凡大众之朝参、夕聚、斋粥、普请等皆有规定。学众聚居僧堂，依受戒年次安排；并设长连床，供坐禅偃息。而住持须为兼具道眼及德行者，居住于方丈之中，时时出法堂，上堂升座、小参垂示，以御大众。凡此种种遂成为丛林新例，而与律法不同。世人即称为百丈清规。此后天下丛林皆依准此规为寺院生活之仪则。然后世亦有以禅林清规系违背佛制之戒律，而加以诋毁者。
百丈清规一书历经唐末、五代逐渐散佚，今部分见于杨亿之禅门规式及百丈规绳颂两书之中。百丈清规之后，我国陆续撰出之清规有：宋代宗赜作禅苑清规（崇宁清规）十卷、瑞严之无量宗寿禅师作日用小清规（入众日用清规、入众清规、日用规范）一卷、婺州金华之惟勉禅师作丛林校定清规总要（咸淳清规、校定清规、婺州清规）二卷、元代东林泽山之咸禅师作禅林备用清规（至大清规、泽山清规、东林清规）十卷、中峰明本禅师作幻住庵清规一卷、江西百丈山住持德辉奉敕重编敕修百丈清规二卷、道齐作禅苑清规总要二卷、继洪作村寺清规一卷、明代寿昌下第三祖天界之道盛禅师作寿昌清规一卷。其中敕修百丈清规系将崇宁、咸淳、至大三本及幻住清规等加以删繁补缺，重新诠次，分成九章，厘为二卷。从明迄今皆通行此本，虽其名仍为百丈清规，然内容精神已去古清规益远。九章中，前四章规定有关祝圣、国忌、祈祷、佛诞节、涅槃节、达摩忌、百丈忌及各寺历代诸祖忌等仪式。此皆律所未定，古规所缺者。五至九章，则为丛林本身之规章制度。此外，其他宗派亦仿效清规所制定之规制，如律宗之省悟作律苑事规三卷，天台宗之自庆作教苑清规一卷。明代后，教门之规制混乱，丛林之行法亦随之废弛。
在日本，关于清规之撰述，有曹洞宗所依用之道元禅师作永平清规、绍瑾禅师作莹山清规、即中玄透作永平小清规，临济宗所依用之清拙正澄作大鉴清规、东渐易公作丛林拾遗略清规、无著道忠作小丛林清规。至德川时代则有黄檗宗之隐元隆琦作黄檗清规、妙心派之小丛林略清规、曹洞宗面山作僧堂清规等。另有净土宗慈空之莲门清规、日莲宗日灯之草山清规等。
现代丛林中实行清规之主要项目，有：(一)结夏与结冬，丛林极重视之四大节为结夏、解夏、冬至、年朝。结夏，即结夏安居，亦称结制，期日原为每年阴历四月或五月之十五日，解夏则于七月或八月之十五日，然自元代以来，各提前一日，讲习礼仪，以便期内专心修道；结冬则于十月十五日至次年正月十五日之间，结制安居，专修禅法。即所谓冬参夏讲。(二)安单，凡曾受具足戒之比丘，若衣戒牒俱全，游方各寺，皆可挂单暂住。如挂单已久，知其行履可以共住者，即送入禅堂，称为安单。(三)大请职，即一寺之人事安排。为丛林冬期重要行事，一般于每年八月十五日举行。(四)贴单，通常于每年阴历十月十五日公布一寺职事及常住人员名单。(五)打七，禅众为克期取悟，丛林中每年自阴历十月十五日至次年正月七日举行禅七，每七天为一期，或打七，或打十七，不定。此为结冬中重要行事。(六)普请，即普遍邀约大众劳作之谓，又称出坡。(七)岁计，为丛林岁末会计报告。(八)肃众，对僧众违犯清规之处分。(九)榜状牌示，指丛林行事通知方式，通常有知单，贴榜、书状、牌示等。(十)钟鼓法器，为丛林号令之器具［禅籍志卷上、大宋僧史略卷上传禅规法条、景德传灯录卷六末附禅门规式、禅宗丛林制度与中国社会（南怀瑾）］ p4672